在医药行业中，污染问题是多年来一直存在的大难题，其中原料药的污染问题更是行业发展之痛。不过近年来，随着原料药行业竞争的加剧，中国原料药企业已经开始从生产粗放型的低端中间体向精细型的高端产品转变。
　　据悉，低水平的生产是造成国内原料药污染严重的最主要原因，虽然国内制定了颇为严格的排污标准，但是国内真正能够达到标准企业却几乎没有。
　　污染严重一直让原料药生产被社会各界诟病，尤其某些大型企业频频发生环保事件更让有关部门对行业的污染问题倍加关注。
　　工信部消费品司医药处处长李宏表示，国家早就出台了产业调整目录，发酵类原料药一直属于限制发展的项目，但是有些地方对这个目录置若罔闻，执行得很差。我国医药产业结构调整的主要方向就是限制高耗能、高污染和资源性的产品。
　　我国早就制定了严格的排污标准，严于美国标准，和最严的欧盟标准也相差无几。对此国内企业也是叫苦连天。业内人士指出，如果按照国家标准执行，企业需要投入高昂的环保资金，连正常的生产活动也无法开展，“国内几乎没有一家企业达到国家标准。”
　　有关专家指出，国家加大环保监管力度，无疑会增加企业的环保成本，造成企业利润下滑。但是长期看，对原料药行业的发展来说利大于弊，有利于促进企业进行上下游整合，同时促进企业在新药研发上加大投入比例，提升产品竞争力。
　　不过值得欣喜的是，随着医药行业的转型升级，原料药行业也开始不断向下游供应链延伸和转移，国内企业也开始积极获取国际认证，原料药质量也有了较大提高。